Orange: Nomogram

From OnnoWiki
Jump to navigation Jump to search

Sumber: https://docs.biolab.si//3/visual-programming/widgets/visualize/nomogram.html


Widget Nomogram untuk mem-visualisasi classifier Naive Bayes dan classifier Logistic Regression.

Input

Classifier: trained classifier
Data: input dataset

Output

Features: selected variables, 10 by default

Widget Nomogram memungkinkan representasi visual beberapa classifier (tepatnya Naive Bayes classifier dan Logistic Regression). Widget Nomogram menawarkan wawasan tentang struktur data training dan efek atribut pada probabilitas class. Selain visualisasi dari classifier, widget Nomogram menawarkan dukungan interaktif untuk prediksi probabilitas class. Cuplikan di bawah ini menunjukkan nomogram dari dataset Titanic, yang memodelkan probabilitas dari penumpang yang tidak survive dalam kecelakaan Titanic.

Pada saat banyak atribut yang bisa di plot dari dataset, hanya yang rank terbaik yang akan di pilih untuk di tayangkan. Kita mungkin memilih dari ‘No sorting’, ‘Name’, ‘Absolute importance’, ‘Positive influence’ dan ‘Negative influence’ untuk representasi Naive Bayes dan dari ‘No sorting’, ‘Name’ dan ‘Absolute importance’ untuk representasi Logistic Regression.

Probabilitas dari target class yang dipilih di hitung dengan prinsip ‘1-vs-all’ , yang sebaiknya di ambil sebagai prinsip dalam memilih multiclass data (jika total probabilitas tidak 1). Untuk menghindari ketidak nyamanan ini, kita dapat me-normalisasi probabilitas.

Nomogram-NaiveBayes.png
  • Select the target class you want to model the probability for. Select, whether you want to normalize the probabilities or not.
  • By default Scale is set to Log odds ration. For easier understanding and interpretation option Point scale can be used. The unit is obtained by re-scaling the log odds so that the maximal absolute log odds ratio in the nomogram represents 100 points.
  • Display all attributes or only the best ranked ones. Sort them and set the projection type.

Continuous attributes can be plotted in 2D (only for Logistic Regression).

Nomogram-LogisticRegression.png

Contoh

Widget Nomogram sebaiknya digunakan langsung sesudah training widget classifier (yaitu, Naive Bayes atau Logistics Regression). Widget Nomorgram juga dapat mengirimkan data instance menggunakan widget yang memungkinkan selection (seperti widget Data Table) seperti tampak pada workflow di bawah ini.

Nomogram-Example.png

Mengacu pada dataset Titanic sekali lagi, 1490 (68%) penumpang Titanic dari 2201 meninggal. Untuk membuat prediksi, kontribusi setiap atribut diukur sebagai skor poin dan skor poin individu dijumlahkan untuk menentukan probabilitas. Ketika nilai atribut tidak diketahui, kontribusinya adalah 0 poin. Oleh karena itu, tanpa mengetahui apa pun tentang penumpang, skor poin total adalah 0 dan probabilitas yang sesuai sama dengan sebelumnya tanpa syarat. Widget Nomogram dalam contoh menunjukkan kasus ketika kita tahu bahwa penumpang adalah laki-laki dewasa dari kelas satu. Jumlah poin menjadi -0,36, dengan probabilitas yang sesuai untuk tidak survive sekitar 53%.

Contoh berikut memperlihatkan bagaimana menggunakan Features output. Kita menggunakan data heart_disease untuk latihan ini dan di load menggunakan widget File. Connect widget File ke widget Naive Bayes (atau widget Logistic Regression) dan tambahkan ke widget Nomogram ke widget Naive Bayes. Akhirnya, connect widget File ke widget Select Columns.

Widget Select Columns akan memilih sebuah subset dari variabel, dimana widget Nomogram akan menayangkan top scoring variabel untuk trained classifier. Untuk memfilter data berdasarkan variabel yang dipilih dalam widget Nomogram, sambungkan widget Nomogram ke widget Select Columns seperti yang ditunjukkan di bawah ini. Widget Nomogram akan meneruskan daftar variabel yang dipilih ke widget Select Columns, yang hanya akan mempertahankan variabel dari daftar. Agar ini berfungsi, kita harus menekan Use input features di widget Select Columns (atau centang untuk always apply it).

Kita telah memilih 5 variabel teratas dalam widget Nomogram dan menggunakan widget Select Columns untuk mempertahankan hanya variabel-variabel tersebut.

Nomogram-Features.png

Referensi

Pranala Menarik