Difference between revisions of "Orange: Distance Matrix"

From OnnoWiki
Jump to navigation Jump to search
(Created page with "Sumber: https://docs.biolab.si//3/visual-programming/widgets/unsupervised/distancematrix.html Visualizes distance measures in a distance matrix. Inputs Distances: dis...")
 
 
(6 intermediate revisions by the same user not shown)
Line 1: Line 1:
 
Sumber: https://docs.biolab.si//3/visual-programming/widgets/unsupervised/distancematrix.html
 
Sumber: https://docs.biolab.si//3/visual-programming/widgets/unsupervised/distancematrix.html
  
 +
Widget Distance Matrix dapat mem-visualisasikan hasil pengukuran distance dalam sebuah distance matrix.
  
 +
==Input==
  
Visualizes distance measures in a distance matrix.
+
Distances: distance matrix
  
Inputs
+
==Output==
  
    Distances: distance matrix
+
Distances: distance matrix
 +
Table: distance measures in a distance matrix
  
Outputs
+
Widget Distance Matrix membuat distance matrix, yang merupakan array dua dimensi yang berisi distance, diambil berpasangan, di antara elemen-elemen dari dataset. Jumlah elemen dalam dataset menentukan ukuran matrix. Matrix data sangat penting untuk Widget Hierarchical Clustering dan mereka sangat berguna dalam bioinformatika, di mana mereka digunakan untuk merepresentasikan struktur protein dengan cara yang bebas koordinat.
  
    Distances: distance matrix
+
[[File:DistanceMatrix-stamped.png|center|200px|thumb]]
  
    Table: distance measures in a distance matrix
+
* Elements in the dataset and the distances between them.
 +
* Label the table. The options are: none, enumeration, according to variables.
 +
* Produce a report.
 +
* Click Send to communicate changes to other widgets. Alternatively, tick the box in front of the Send button and changes will be communicated automatically (Send Automatically).
  
The Distance Matrix widget creates a distance matrix, which is a two-dimensional array containing the distances, taken pairwise, between the elements of a set. The number of elements in the dataset defines the size of the matrix. Data matrices are essential for hierarchical clustering and they are extremely useful in bioinformatics as well, where they are used to represent protein structures in a coordinate-independent manner.
+
Hanya dua input yang cocok untuk Widget Distance Matrix yaitu widget Distances dan widget Distance Transformation. Output dari widget Distance Matrix adalah tabel data yang berisi distance matrix. Pengguna dapat memutuskan bagaimana memberi label pada tabel dan distance matrix (atau contoh dalam distance matrix) kemudian dapat divisualisasikan atau ditampilkan dalam tabel data terpisah.
  
../../_images/DistanceMatrix-stamped.png
+
==Contoh==
 
 
    Elements in the dataset and the distances between them.
 
 
 
    Label the table. The options are: none, enumeration, according to variables.
 
 
 
    Produce a report.
 
 
 
    Click Send to communicate changes to other widgets. Alternatively, tick the box in front of the Send button and changes will be communicated automatically (Send Automatically).
 
 
 
The only two suitable inputs for Distance Matrix are the Distances widget and the Distance Transformation widget. The output of the widget is a data table containing the distance matrix. The user can decide how to label the table and the distance matrix (or instances in the distance matrix) can then be visualized or displayed in a separate data table.
 
Example
 
 
 
The example below displays a very standard use of the Distance Matrix widget. We compute the distances between rows in the sample from the Iris dataset and output them in the Distance Matrix. It comes as no surprise that Iris Virginica and Iris Setosa are the furthest apart.
 
 
 
../../_images/DistanceMatrix-Example.png
 
  
 +
Contoh workflow di bawah ini menampilkan penggunaan widget Distance Matrix yang sangat standar. Kita menghitung jarak antara baris dalam sampel dari dataset Iris dan mengeluarkannya dalam Distance Matrix. Tidaklah mengejutkan bahwa Iris Virginica dan Iris Setosa adalah yang terjauh.
  
 +
[[File:DistanceMatrix-Example.png|center|600px|thumb]]
  
 
==Referensi==
 
==Referensi==

Latest revision as of 16:30, 7 April 2020

Sumber: https://docs.biolab.si//3/visual-programming/widgets/unsupervised/distancematrix.html

Widget Distance Matrix dapat mem-visualisasikan hasil pengukuran distance dalam sebuah distance matrix.

Input

Distances: distance matrix

Output

Distances: distance matrix
Table: distance measures in a distance matrix

Widget Distance Matrix membuat distance matrix, yang merupakan array dua dimensi yang berisi distance, diambil berpasangan, di antara elemen-elemen dari dataset. Jumlah elemen dalam dataset menentukan ukuran matrix. Matrix data sangat penting untuk Widget Hierarchical Clustering dan mereka sangat berguna dalam bioinformatika, di mana mereka digunakan untuk merepresentasikan struktur protein dengan cara yang bebas koordinat.

DistanceMatrix-stamped.png
  • Elements in the dataset and the distances between them.
  • Label the table. The options are: none, enumeration, according to variables.
  • Produce a report.
  • Click Send to communicate changes to other widgets. Alternatively, tick the box in front of the Send button and changes will be communicated automatically (Send Automatically).

Hanya dua input yang cocok untuk Widget Distance Matrix yaitu widget Distances dan widget Distance Transformation. Output dari widget Distance Matrix adalah tabel data yang berisi distance matrix. Pengguna dapat memutuskan bagaimana memberi label pada tabel dan distance matrix (atau contoh dalam distance matrix) kemudian dapat divisualisasikan atau ditampilkan dalam tabel data terpisah.

Contoh

Contoh workflow di bawah ini menampilkan penggunaan widget Distance Matrix yang sangat standar. Kita menghitung jarak antara baris dalam sampel dari dataset Iris dan mengeluarkannya dalam Distance Matrix. Tidaklah mengejutkan bahwa Iris Virginica dan Iris Setosa adalah yang terjauh.

DistanceMatrix-Example.png

Referensi

Pranala Menarik